MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Rhodococcus jostii RHA1 chromosome

Total Repeats: 185852

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_008268	GGT	2	6	1403	1408	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	111017023
2	NC_008268	TGG	2	6	1420	1425	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	111017023
3	NC_008268	GGC	2	6	1460	1465	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111017023
4	NC_008268	GC	3	6	1531	1536	0 %	0 %	50 %	50 %	111017023
5	NC_008268	GGT	2	6	1553	1558	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	111017023
6	NC_008268	CTG	2	6	1568	1573	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111017023
7	NC_008268	GAG	2	6	1604	1609	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	111017023
8	NC_008268	GAT	2	6	1616	1621	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	111017023
9	NC_008268	TCG	2	6	1626	1631	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111017023
10	NC_008268	TGC	2	6	1639	1644	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111017023
11	NC_008268	CG	3	6	1650	1655	0 %	0 %	50 %	50 %	111017023
12	NC_008268	CGC	2	6	1727	1732	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111017023
13	NC_008268	CGA	2	6	1747	1752	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111017023
14	NC_008268	CCCG	2	8	1767	1774	0 %	0 %	25 %	75 %	111017023
15	NC_008268	GGT	2	6	1786	1791	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	111017023
16	NC_008268	GCG	2	6	1799	1804	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111017023
17	NC_008268	GGC	4	12	1855	1866	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111017023
18	NC_008268	TGGA	2	8	1923	1930	25 %	25 %	50 %	0 %	111017023
19	NC_008268	CAG	2	6	1997	2002	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111017023
20	NC_008268	CAG	2	6	2009	2014	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111017023
21	NC_008268	TCG	2	6	2016	2021	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111017023
22	NC_008268	GCC	2	6	2075	2080	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111017023
23	NC_008268	GTA	2	6	2126	2131	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	111017023
24	NC_008268	CG	3	6	2288	2293	0 %	0 %	50 %	50 %	111017023
25	NC_008268	CGA	2	6	2321	2326	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111017023
26	NC_008268	GCA	2	6	2344	2349	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111017023
27	NC_008268	GCG	2	6	2362	2367	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111017023
28	NC_008268	CCT	2	6	2416	2421	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	111017023
29	NC_008268	GC	3	6	2425	2430	0 %	0 %	50 %	50 %	111017023
30	NC_008268	CAA	2	6	2434	2439	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	111017023
31	NC_008268	ATC	2	6	2469	2474	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	111017023
32	NC_008268	ATC	2	6	2481	2486	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	111017023
33	NC_008268	CG	4	8	2513	2520	0 %	0 %	50 %	50 %	111017023
34	NC_008268	ACC	2	6	3606	3611	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	111017024
35	NC_008268	GTC	2	6	3663	3668	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111017024
36	NC_008268	CGC	2	6	3671	3676	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111017024
37	NC_008268	CGG	2	6	3677	3682	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111017024
38	NC_008268	GCA	2	6	3712	3717	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111017024
39	NC_008268	ACCGC	2	10	3744	3753	20 %	0 %	20 %	60 %	111017024
40	NC_008268	CCG	2	6	3769	3774	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111017024
41	NC_008268	GCC	2	6	3777	3782	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111017024
42	NC_008268	CCGA	2	8	3785	3792	25 %	0 %	25 %	50 %	111017024
43	NC_008268	GAC	2	6	3822	3827	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111017024
44	NC_008268	GAC	2	6	3830	3835	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111017024
45	NC_008268	GAC	2	6	3838	3843	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111017024
46	NC_008268	CGA	2	6	3885	3890	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111017024
47	NC_008268	GCT	2	6	3921	3926	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111017024
48	NC_008268	CCG	2	6	3930	3935	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111017024
49	NC_008268	CGC	2	6	3948	3953	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111017024
50	NC_008268	CAC	2	6	3978	3983	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	111017024
51	NC_008268	GCCG	2	8	4008	4015	0 %	0 %	50 %	50 %	111017024
52	NC_008268	GTCATG	2	12	4018	4029	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	111017024
53	NC_008268	CGA	2	6	4041	4046	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111017024
54	NC_008268	CGACC	2	10	4059	4068	20 %	0 %	20 %	60 %	111017024
55	NC_008268	CGC	2	6	4101	4106	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111017024
56	NC_008268	CGAG	2	8	4109	4116	25 %	0 %	50 %	25 %	111017024
57	NC_008268	ACT	2	6	4152	4157	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	111017025
58	NC_008268	CGC	2	6	4230	4235	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111017025
59	NC_008268	GGAT	2	8	4282	4289	25 %	25 %	50 %	0 %	111017025
60	NC_008268	TCG	2	6	4300	4305	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111017025
61	NC_008268	CGC	2	6	4330	4335	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111017025
62	NC_008268	TGCCC	2	10	4344	4353	0 %	20 %	20 %	60 %	111017025
63	NC_008268	C	6	6	4377	4382	0 %	0 %	0 %	100 %	111017025
64	NC_008268	GGC	2	6	4413	4418	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111017025
65	NC_008268	GACA	2	8	4440	4447	50 %	0 %	25 %	25 %	111017025
66	NC_008268	GTT	2	6	4460	4465	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	111017025
67	NC_008268	CAC	2	6	4480	4485	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	111017025
68	NC_008268	AGCG	2	8	4506	4513	25 %	0 %	50 %	25 %	111017025
69	NC_008268	TCCGG	2	10	4565	4574	0 %	20 %	40 %	40 %	111017025
70	NC_008268	GCC	3	9	4598	4606	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111017025
71	NC_008268	AGAC	2	8	4626	4633	50 %	0 %	25 %	25 %	111017025
72	NC_008268	TGG	2	6	4640	4645	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	111017025
73	NC_008268	AGG	2	6	4658	4663	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	111017025
74	NC_008268	CAT	3	9	4679	4687	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	111017025
75	NC_008268	GAC	2	6	4695	4700	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111017025
76	NC_008268	GAG	2	6	4717	4722	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	111017025
77	NC_008268	CCGA	2	8	4751	4758	25 %	0 %	25 %	50 %	111017025
78	NC_008268	ACCG	2	8	4774	4781	25 %	0 %	25 %	50 %	111017025
79	NC_008268	CGC	2	6	4785	4790	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111017025
80	NC_008268	CCGC	2	8	4823	4830	0 %	0 %	25 %	75 %	111017025
81	NC_008268	CTG	2	6	4912	4917	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111017025
82	NC_008268	CGC	2	6	4968	4973	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111017025
83	NC_008268	TCG	2	6	4976	4981	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111017025
84	NC_008268	CGC	2	6	4986	4991	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111017025
85	NC_008268	CGA	2	6	5016	5021	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111017025
86	NC_008268	GAT	2	6	5040	5045	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	111017025
87	NC_008268	ACG	2	6	5075	5080	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111017025
88	NC_008268	CTC	2	6	5113	5118	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	111017025
89	NC_008268	CCG	2	6	5147	5152	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111017025
90	NC_008268	CAC	2	6	5161	5166	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	111017025
91	NC_008268	CCA	2	6	5179	5184	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	111017025
92	NC_008268	CGA	2	6	5229	5234	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111017025
93	NC_008268	CGC	2	6	5235	5240	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111017025
94	NC_008268	C	6	6	5258	5263	0 %	0 %	0 %	100 %	111017025
95	NC_008268	CGA	2	6	5304	5309	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111017025
96	NC_008268	CTG	2	6	6253	6258	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111017026
97	NC_008268	GTCG	2	8	6278	6285	0 %	25 %	50 %	25 %	111017026
98	NC_008268	GCG	2	6	6336	6341	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111017026
99	NC_008268	ACC	2	6	6420	6425	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	111017026
100	NC_008268	CAG	2	6	6473	6478	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111017026
101	NC_008268	ACG	2	6	6481	6486	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111017026
102	NC_008268	GTG	2	6	6528	6533	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	111017026
103	NC_008268	CCGG	2	8	6539	6546	0 %	0 %	50 %	50 %	111017026
104	NC_008268	CGAC	2	8	6550	6557	25 %	0 %	25 %	50 %	111017026
105	NC_008268	GCG	2	6	6579	6584	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111017026
106	NC_008268	TC	3	6	6639	6644	0 %	50 %	0 %	50 %	111017026
107	NC_008268	CGG	2	6	6654	6659	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111017026
108	NC_008268	AC	3	6	6707	6712	50 %	0 %	0 %	50 %	111017026
109	NC_008268	CGG	2	6	6759	6764	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111017026
110	NC_008268	G	6	6	6851	6856	0 %	0 %	100 %	0 %	111017026
111	NC_008268	CGC	2	6	6859	6864	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111017026
112	NC_008268	ACC	2	6	6986	6991	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	111017027
113	NC_008268	CAC	2	6	7027	7032	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	111017027
114	NC_008268	TGG	2	6	7092	7097	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	111017027
115	NC_008268	GGC	2	6	7110	7115	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111017027
116	NC_008268	CAG	2	6	7118	7123	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111017027
117	NC_008268	CGA	2	6	7219	7224	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111017027
118	NC_008268	ACC	2	6	7403	7408	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	111017027
119	NC_008268	CGA	2	6	7441	7446	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111017027
120	NC_008268	GGC	2	6	7456	7461	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111017027
121	NC_008268	CG	3	6	7513	7518	0 %	0 %	50 %	50 %	111017027
122	NC_008268	GCACC	2	10	7544	7553	20 %	0 %	20 %	60 %	111017027
123	NC_008268	CTG	2	6	7595	7600	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111017027
124	NC_008268	GGC	3	9	7635	7643	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111017027
125	NC_008268	CGA	2	6	7648	7653	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111017027
126	NC_008268	GCACCG	4	24	7667	7690	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	111017027
127	NC_008268	CG	3	6	7720	7725	0 %	0 %	50 %	50 %	111017027
128	NC_008268	CGA	2	6	7727	7732	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111017027
129	NC_008268	CGA	2	6	7798	7803	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111017027
130	NC_008268	GTG	2	6	7805	7810	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	111017027
131	NC_008268	CAC	2	6	7822	7827	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	111017027
132	NC_008268	TGC	2	6	7830	7835	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111017027
133	NC_008268	ACG	2	6	7871	7876	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111017027
134	NC_008268	GCC	2	6	7925	7930	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111017027
135	NC_008268	CTCC	2	8	7942	7949	0 %	25 %	0 %	75 %	111017027
136	NC_008268	CGC	2	6	7988	7993	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111017027
137	NC_008268	CTCA	2	8	8011	8018	25 %	25 %	0 %	50 %	111017027
138	NC_008268	CGG	2	6	8019	8024	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111017027
139	NC_008268	CGC	2	6	8041	8046	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111017027
140	NC_008268	ATC	2	6	8159	8164	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	111017027
141	NC_008268	CGC	2	6	8170	8175	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111017027
142	NC_008268	CCG	2	6	8235	8240	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111017027
143	NC_008268	CGG	2	6	8254	8259	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111017027
144	NC_008268	CGC	2	6	8269	8274	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111017027
145	NC_008268	CGGC	2	8	8284	8291	0 %	0 %	50 %	50 %	111017027
146	NC_008268	CAT	2	6	8305	8310	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	111017027
147	NC_008268	TG	3	6	8335	8340	0 %	50 %	50 %	0 %	111017027
148	NC_008268	CCCG	2	8	8414	8421	0 %	0 %	25 %	75 %	111017027
149	NC_008268	ACCG	2	8	8430	8437	25 %	0 %	25 %	50 %	111017027
150	NC_008268	CGT	2	6	11276	11281	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111017028
151	NC_008268	GA	3	6	11314	11319	50 %	0 %	50 %	0 %	111017028
152	NC_008268	GAA	2	6	11322	11327	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	111017028
153	NC_008268	TCG	2	6	11329	11334	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111017028
154	NC_008268	ATC	2	6	11344	11349	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	111017028
155	NC_008268	TCT	2	6	11372	11377	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	111017028
156	NC_008268	CAT	2	6	11403	11408	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	111017028
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158	NC_008268	CGGC	2	8	12466	12473	0 %	0 %	50 %	50 %	111017029
159	NC_008268	AGC	2	6	12474	12479	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111017029
160	NC_008268	CCG	2	6	12493	12498	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111017029
161	NC_008268	CGG	2	6	12499	12504	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111017029
162	NC_008268	GC	3	6	12548	12553	0 %	0 %	50 %	50 %	111017029
163	NC_008268	GGC	2	6	12561	12566	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111017029
164	NC_008268	CTG	2	6	12624	12629	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111017029
165	NC_008268	ACC	2	6	12631	12636	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	111017029
166	NC_008268	ACG	2	6	12654	12659	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111017029
167	NC_008268	CAT	2	6	15112	15117	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	111017030
168	NC_008268	CGG	2	6	15129	15134	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111017030
169	NC_008268	CAC	2	6	15148	15153	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	111017030
170	NC_008268	CGG	2	6	15157	15162	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111017030
171	NC_008268	GC	3	6	15205	15210	0 %	0 %	50 %	50 %	111017030
172	NC_008268	CAT	2	6	15217	15222	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	111017030
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174	NC_008268	CAA	2	6	15416	15421	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	111017031
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179	NC_008268	CAC	2	6	15967	15972	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	111017032
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183	NC_008268	CCG	2	6	16387	16392	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111017032
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191	NC_008268	GAC	2	6	18311	18316	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111017033
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211	NC_008268	ACG	2	6	19134	19139	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111017033
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213	NC_008268	GCA	2	6	19214	19219	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111017033
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220	NC_008268	GC	3	6	19388	19393	0 %	0 %	50 %	50 %	111017033
221	NC_008268	CGA	2	6	19453	19458	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111017033
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224	NC_008268	CTG	2	6	19673	19678	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111017033
225	NC_008268	ACT	2	6	19719	19724	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	111017033
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237	NC_008268	GCG	2	6	20088	20093	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111017033
238	NC_008268	TCG	2	6	20118	20123	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111017033
239	NC_008268	CGA	2	6	20128	20133	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111017033
240	NC_008268	ACCCGC	3	18	20150	20167	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	111017033
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242	NC_008268	GCCG	2	8	20291	20298	0 %	0 %	50 %	50 %	111017033
243	NC_008268	CAA	2	6	20337	20342	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	111017033
244	NC_008268	CGC	2	6	20357	20362	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111017033
245	NC_008268	ACCGGC	2	12	20386	20397	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	111017033
246	NC_008268	GTC	2	6	21740	21745	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111017034
247	NC_008268	CAC	2	6	21749	21754	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	111017034
248	NC_008268	CGA	2	6	21823	21828	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111017034
249	NC_008268	CCT	2	6	22038	22043	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	111017035
250	NC_008268	TG	3	6	22050	22055	0 %	50 %	50 %	0 %	111017035
251	NC_008268	CCG	2	6	22074	22079	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111017035
252	NC_008268	ATC	2	6	22092	22097	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	111017035
253	NC_008268	GTGA	2	8	22101	22108	25 %	25 %	50 %	0 %	111017035
254	NC_008268	ATG	2	6	22118	22123	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	111017035
255	NC_008268	TGC	2	6	22202	22207	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111017035
256	NC_008268	GC	3	6	22238	22243	0 %	0 %	50 %	50 %	111017035
257	NC_008268	CTT	2	6	22279	22284	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	111017035
258	NC_008268	CCG	2	6	22292	22297	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111017035
259	NC_008268	GCA	2	6	22405	22410	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111017035
260	NC_008268	CGC	2	6	22511	22516	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111017035
261	NC_008268	AC	3	6	22525	22530	50 %	0 %	0 %	50 %	111017035
262	NC_008268	GCG	2	6	22608	22613	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111017035
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264	NC_008268	GAA	2	6	22685	22690	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	111017035
265	NC_008268	TCGGCC	2	12	22706	22717	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	111017035
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267	NC_008268	CGA	2	6	22756	22761	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111017035
268	NC_008268	TCG	2	6	22797	22802	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111017035
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270	NC_008268	ACCA	2	8	22935	22942	50 %	0 %	0 %	50 %	111017035
271	NC_008268	CGC	2	6	23014	23019	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111017035
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377	NC_008268	CACAG	2	10	28415	28424	40 %	0 %	20 %	40 %	111017043
378	NC_008268	CGGA	2	8	28523	28530	25 %	0 %	50 %	25 %	111017043
379	NC_008268	TGT	2	6	28577	28582	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	111017043
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381	NC_008268	CAG	2	6	28752	28757	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111017043
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